Equipe Gemfor
Laure Villate
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page personnelle
RECHERCHE
J'utilise une approche combinant des concepts d'écologie (notamment écologie évolutive) et de biologie et génétique des populations pour étudier l’interaction entre le pin et trois de ses bio-agresseurs: le champignon Diplodia sapinea, les nématodes Bursaphelenchus spp. et leurs coléoptères vecteurs.
ENSEIGNEMENT
Je participe à l'enseignement à différents niveaux de la formation proposée par l'Université de Bordeaux en Licence BOE (Biologie des Organismes et Environnement) et en Master BEC (Biodiversité des Écosystèmes Continentaux).
Licence Biologie des Organismes et Environnement :
- L1 : - Diversité et évolution des métazoaires (UE Unité et diversité du vivant)
- L2 : - Génétique des populations (UE Écologie et génétique des populations)
- L3 : - Génétique des populations (UE Analyse moléculaire des organismes)
- Écologie (UE Écologie et Aménagement)
Master Biodiversité des Écosystèmes continentaux :
- Master 1 : - Étude de la pédofaune (UE Science et écologie des sols)
- Ecologie évolutive: sélection naturelle (UE Ecologie évolutive et dynamique des
populations)
- En Master 2 : je suis co-responsable (avec Pauline Garnier-Géré) de l'UE Génétique évolutive, qui fournit les bases théoriques et les méthodes pour l'étude de la diversité génétique en populations naturelles et des différents processus d'évolution des espèces, et qui permet de comprendre l'adaptation des espèces à leur environnement et la formation de nouvelles espèces.
Dans cette UE, mes cours portent sur l'évolution moléculaire intraspécifique, sur l'inférence en génétique des populations (modèle neutre, écarts à la neutralité, etc...), sur la structuration spatiale des populations et les flux de gènes, sur la spéciation, et sur les applications concrètes des principes d'écologie évolutive.
J'interviens également dans l'UE Interactions biotiques dans les communautés végétales
- Nématodes phytoparasites et virus de plantes
- Écologie, diversité et évolution des populations de champignons pathogènes
J'interviens également dans les enseignements de Bordeaux Science Agro :
- Module ‘Diversité du vivant’ : Nématodes et gestion des viroses en viticulture
PUBLICATIONS
Publications dans des revues internationales avec comité de lecture :
Lepoittevin C, Bodénès C, Chancerel E, Villate L, Lang T, Lesur I, Boury C, Ehrenmann F, Zelenica D, Boland A, Besse C, Garnier-Géré P, Plomion C, Kremer A (2015) Single-nucleotide polymorphism discovery and validation in high density SNP array for genetic analysis in European white oaks. Molecular Ecology Resources.
Villate L, Fievet V, Hanse B, Delemarre F, Esmenjaud D, Plantard O and van Helden M (2008). Spatial distribution of the dagger nematode Xiphinema index and its associated Grapevine fanleaf virus in French vineyards. Phytopathology, 98(8), 942 -948.
Villate L, Esmenjaud D, Coedel S and Plantard O (2009). Development of nine polymorphic microsatellite markers for the phytoparasitic nematode Xiphinema index, the vector of Grapevine FanLeaf Virus. Molecular Ecology Ressources, 9(1), 229-232.
Villate L, Stoeckel S, van helden M and Plantard O (2010). Genetic signature of amphimixis allows for the detection and fine scale localization of sexual reproduction events in a mainly parthenogenetic nematode. Molecular Ecology, 19(5), 856-873.
Morgan K, McGaughran A, Villate L, Herrmann M, Rochat J and Sommer R (2012). Multi-locus analysis of Pristionchus pacificus on La Réunion Island reveals an evolutionary history shaped by multiple introductions, constrained dispersal events, and rare out-crossing. Molecular Ecology, 21(2), 250-66.
Villate L, Demangeat G, Morin E, van Helden M and Esmenjaud D (2012). Antagonistic effect of plants against Xiphinema index, the nematode vector of the Grapevine fanleaf virus, under greenhouse and field conditions. Phytopathology, 102(6), 627-634.
Molnar R, Witte H, Dinkelacker I, Villate L and Sommer R (2012). Mutation rate of microsatellites in Pristionchus pacificus. G3 Genes Genomes Genetics, 2(9), 1027-34.
Lepoittevin C, Chancerel E, Villate L et al. Single-nucleotide polymorphism discovery and high-density SNP array development for genetic analysis in European white oaks. Soumis à Molecular Ecology Resources.
Publications dans des revues françaises:
Laveau C, Villate L, Morin E and van Helden M (2009). Court-Noué de la vigne : Optimiser la gestion des parcelles contaminées. Union Girondine des vins de Bordeaux, Décembre 2009.
Darrieutort G, Laveau C, Villate L, van Helden M (2010). Court-noué de la vigne : des outils pour une meilleure gestion. Union Girondine des vins de Bordeaux, Novembre 2010.
Thèse et rapports :
Villate L (2008). Origine, variabilité et gestion des populations de Xiphinema index, le nématode vecteur du Grapevine fanleaf virus (GFLV). Thèse de doctorat. Agrocampus Rennes. 159 p.
Villate L (2004). Génétique des populations du nématode à kyste de la betterave, Heterodera schachtii, associé à la betterave maritime, Beta maritima, sur le littoral français. Rapport de Master 2 Éco-Éthologie Évolutive, Université Rennes 1. 24 p.
Villate L (2003). Étude de la dynamique des populations du Puceron cendré du Pommier (Dysaphis plantaginea PASSERINI) sur son hôte secondaire, le Plantain (Plantago lanceolata). Rapport de Maîtrise Biologie des Populations et des Écosystèmes, Université Paul Sabatier, Toulouse. 35 p.
Communications :
Villate L and Plantard O (2004). Génétique des populations du nématode à kyste Heterodera schachtii, associé à la betterave maritime Beta maritima sur le littoral français. Petit Pois Déridé, Paris, France.
Villate L , Hanse B, Delemarre F and van Helden M (2006). Horizontal and vertical distributions of Xiphinema index, vector of the Grapevine fanleaf virus (GFLV) in Bordeaux vineyard. Symposium of the European Society of Nematology, Blagoevgrad, Bulgaria.
Villate L, van Helden M, Voisin R, Esmenjaud D and Plantard O (2006). Genetic variability of Xiphinema index inferred by microsatellite loci and mitochondrial data. Symposium of the European Society of Nematology, Blagoevgrad, Bulgaria.
Villate L, van Helden M, Delemarre F, Esmenjaud D and Plantard O (2006). Distribution spatiale et origine des populations de Xiphinema index, le nématode vecteur du Grapevine fanleaf virus (GFLV). Petit Pois Déridé, Lille, France.
Villate L, Morin E, Esmenjaud D and van Helden M (2007). Nematicidal plants against Xiphinema index, the nematode vector of the Grapevine fanleaf virus (GFLV). International Meeting “Control of Xiphinema index, nematode vector of Grapevine fanleaf virus”, INRA Colmar, France.
Villate L, van Helden M, Esmenjaud D and Plantard O (2008). Genetic variability of Xiphinema index, the nematode vector of Grapevine fanleaf virus (GFLV), inferred by microsatellites loci and mitochondrial sequences. International Congress of Nematology, Brisbane, Australia.
Villate L , Stoeckel S, van Helden M, Esmenjaud D and Plantard O (2008). Rare sexual reproduction events in a parthenogenetic nematode. Petit Pois Déridé, Rennes, France.
Stoeckel S, Druet K, Parisey N, Jaquiery J, Villate L, Mariette S, Simon JC and Masson JP (2010). Conséquences de la reproduction partiellement asexuée sur la dynamique de perte de diversité génétique par dérive. Écologie 2010, Montpellier, France.
Van Helden M, Villate L, Laveau C, Morin E, Darrieutort G and Van Leewen C (2010) Monitoring nematode populations to adapt fallow periods against Xiphinema vectors of Grapevine fanleaf virus (GFLV). IOBC working group “Integrated Protection and Production in Viticulture”, Staatliches Weinbauinstitut Freiburg, November 1-4, 2010, Staufen im Breisgau, Germany.
Villate L, Bodénès C, Chancerel E, Plomion C, Kremer A (2012) Genome scan of interspecific divergence in European White Oaks. IUFRO 2012 Conference (Genetics of Fagaceae and Nothofagaceae), 9-12th October 2012, Bordeaux, France.
